El trabajo en equipo y las historias de
grupos

superpoderosos son la base clásica de las

historias fantásticas. De esto

se darán cuenta al enterarse de cada detalle de la historia de Tokyo Mew Mew. 

Zoey Hanson (Ichigo Momomiya) es una chica común y corriente enamorada de Mark (Masaya Aoyama), el chico más lindo de su colegio. El día que finalmente se anima a invitarlo a una exposición de Red Data Animals (especies en peligro de extinción) hay un terremoto y una extraña luz la cubre. Después de soñar que un gato ingresa en su cuerpo, Zoey (Ichigo) empieza a actuar cada vez más como un felino (salta desde balcones, agarra pescados con la boca, etc.). Ahí hacen su aparición dos chicos, Wesley (Keichiro) y Elliott (Ryou), que le explican lo que en verdad está sucediendo: en la ciudad hay varios extraterrestres llamados Cyniclons, que están enojados y celosos de cómo los humanos acaban con su planeta, así que deciden que es mejor conquistarlo. La clave de su estrategia son los monstruos Predacytes, creados al inyectarles pequeños seres a ciertas plantas y animales.

El trabajo de Zoey (Ichigo) es utilizar sus nuevos poderes para liberar a los seres poseídos por los aliens y también buscar y reclutar a otras cuatro chicas (Corina-Mint, Bridgette-Lettuce, Renée-Zakuro y Kikki-Pudding) que tengan ADN animal. El detalle distintivo de esta serie es que los chicos (Wesley-Keichiro y Elliott-Ryou), además de hacer que las muchachas peleen contra los extraterrestres, las hacen trabajar como meseras en el Café Mew Mew.

Tal como dice el sentido común científico, el ADN humano fusionado con el de un animal en peligro de extinción, hace que cada chica pueda transformarse mágicamente en una superheroína con poderes y objetos particulares.

Algo infaltable de contar es el detalle de los varios pretendientes de nuestra protagonista: tenemos a Mark (Masaya), que se convierte en el protector de Zoey; Elliott (Ryou), el encargado del café y líder del grupo; e incluso unos de los aliens, Dren (Kishu) quien queda enamorado de “su minina” desde el primer momento.

A medida que transcurren los capítulos, las chicas comienzan a buscar las Mew Aquas (las cuales aumentan sus poderes). También aparecen otros aliens llamados Sardon (Pie) y Tarb (Taruto) y más adelante, el alien más poderoso: el misterioso Deep Blue…